Il nuovo Lagoon 46 è stato progettato ancora una volta da VPLP-Design. Il rinomato studio ha optato per un albero posizionato molto a poppa con un grande fiocco autovirante e una randa quasi rettangolare, scafi sporgenti con ondulazioni e pieghe e un flybridge dedicato con una ruota centrale invece di postazioni di guida a mezza altezza.